为了适配自己的超能力，彼得帕克又制作了蛛丝发射器和战斗服，至此蜘蛛侠这个都市传说出现在了地下拳击场。彼得帕克凭借蛛丝发射表演得到酬劳，后来接了地下拳击的活，收获丰厚。

在休息室时由于冷漠放跑了一个犯人，没有出手帮助差人，成果犯人害死了帕克的本叔叔，蜘蛛侠的传奇一生也正式开始。

毒液的能力和蜘蛛侠相当，甚至有过之而无不及，一度将蜘蛛侠逼入绝境，布鲁克也因为毒液记忆共享知道了蜘蛛侠的秘密，对帕克的周围造成了极大的威胁。

但是蜘蛛侠最终发现了毒液的弱点，害怕强力音波，最后将毒液引至火箭发射台，让毒液脱离布鲁克，一举送上太空。

蜘蛛侠后来也和通缉犯变色龙交手，还有猎人克雷文，期间和神盾特工黑寡妇和独眼尼克弗瑞打了照面。

蜘蛛侠由于基因不不变而决意研究自己的血样，意外让俄罗斯转来的大学生迈克尔摩比斯变成了吸血鬼，还大战了惩罚者，局势一片混乱，最终演变成了蜘蛛侠受到万众指责的局势。

蜘蛛侠为了寻求帮助，还去找过变异人团体，期间结识了X战警，和金刚狼成为战友，罗伯特兰登捕捉变异人研究，和蜘蛛侠等人发生冲突，最后自己变异成了半人半怪物的模样。

在蜘蛛侠能力时有时无的状态下，犯罪头子金并召集了六大魔头大战蜘蛛侠，一度将蜘蛛侠逼入绝境，六大魔头为惊悚，犀牛人，章鱼博士，神秘人，变色龙，蝎子。最后蜘蛛侠凭借智慧让六人自相残杀躲过一劫，这场战斗蜘蛛侠卷入了金并和其他黑帮团体的大战之中。

此外还有帕克和玛丽简的感情发展，他们遇到了莫比，玛丽简高中的男友，莫比变异成了水人，可以化身体为水和自由操控水，最后败在了玛丽简的智慧之下。

之后回到和摩比斯交手的剧情上，蜘蛛侠身体节制不住变异，变成了人形蜘蛛怪，在克雷文和惩罚者的帮助下复原。

摩比斯在人类状态下和菲利希亚相爱，因此希望让菲利希亚变成和自己一样的状态，之后和蜘蛛侠交手，不慎将自己变成了吸血蝙蝠，最后躲了起来。蜘蛛侠在这次战斗中结识了吸血鬼猎人刀锋战士。

剧情展开到时光之碑上，时光之碑能够让人重回青春，被金并的死对头盯上，但是其过于自负，把自己变成了小孩，这之间蜘蛛侠大战过铁头人和墓碑。

时光之碑的故事没有结束，托姆斯发明装置来利用时光之碑吸收人的青春转到自己身上，和蜘蛛侠交手，变成了秃鹫，飞在空中制裁了蜘蛛侠并吸收了超能力。

后来蜘蛛侠和康纳斯相互协作，将蜘蛛侠的变异基因转到托姆斯身上，至此，蜘蛛侠真正掌控了超能力，不会因为变异困扰。